各位前輩好，
小妹受指導教授之命必須完成實驗室之前研究成果的專利申請，
目前進行到申復的階段，
在申請專利範圍的部分，有些問題不甚了解，
希望各位能明示。
原本我們申請的專利範圍一共有三項，
基本上是參考實驗室之前已經通過的專利來改的：
1. 一種由OO萃取出之蛋白XXX，其特徵在於具有 SEQ ID 6 之胺基酸序列。
2. 含有如申請專利範圍第 1 項之XXXXXX蛋白之食品組合物，
其特徵在於該組合物具有YYYY功能。
3. 含有如申請專利範圍第 1 項之XXXXXX蛋白之醫藥用組合物，
其特徵在於該組合物具有YYYY功能。
審查認為，第2.3項為第1項之附屬項，
但2.3項所請的分別為食品組合物、醫藥組合物，
與所依附的第一項標的矛盾，故不明確。
不才在下原本以為是因為第一項說的是"一種蛋白"，
故2.3項變成組合物有矛盾，
但看了一些性質較接近、目前已經通過的專利，
很多也是類似的項目，
只是在附屬項會寫成
"一種XX組合物，其包含如請求項Y之化合物或其藥學上可接受之鹽......"
可以請教各位，
在這個部分我的申請範圍的問題究竟出在哪裡呢?
又應該往哪個方向去改?
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