扣繳憑單錯誤 - 稅務

前幾天收到扣繳憑單，
計算之後發現有些無薪的事假沒有扣除，
請教人事後她也很爽快地說會更正。
可是和合作的會計師通電話後，
會計師說她會在線上直接更正，
叫我直接報更正後的數字就可以，
不過不會再給我一張更正後的扣繳憑單。
請問這樣會不會有什麼問題？
人事打電話時我有在場，
所以不會是人事想要挖洞給我跳。

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