今天才收到扣繳憑單要自己報嗎? - 所得稅

因為本身有一些兼差的工作
今天突然收到某家的扣繳憑單
明天都已經要截止報稅了

因為先前的所得稅我都已經算好沒問題了
六月初已經上傳首次申報

今天收到的扣繳憑單有一筆是50薪資的部分
另外有一筆是9A-90的部分
該公司告知他們是6月才完成補報稅程序
所以我用健保卡重新登入查詢所得資料，應該也還沒更新

那我是
1.這兩天快點自行輸入報稅軟體，再度上網更新申報資料
2.或者國稅局七月會登錄此筆補報金額
等國稅局自行計算過後再通知我補繳稅費

哪種會比較適當?
擔心自己重新帶入所得資料會算錯，
或者會有什麼二代健保補充保費的問題?
如果讓國稅局自行補登後計算，再通知我，是會直接寄通知信件給我?
還是會先電話聯繫呢?

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