營業用租賃產生的補繳稅額問題 - 稅務

各位板大好，小弟有一事想問：

我的家人有開店，大約三年，是租來的店面。去年初開始國稅局有向房東要求報稅，房東
後來就報了也繳了。後來國稅局某個承辦人去年下半年也有開單子詢問我家人店面事宜，
我們有向承辦人回電說房東已經報稅也有繳了。

上禮拜這個國稅局承辦人打來要我家人去一趟，然後碰面時就給了一張去年要補繳一整年
的單子（補繳各類所得扣繳稅額繳款書），要我們先去補繳。當下我家人有跟他說房東已
經繳了，也有收據，但承辦人說：我單子已經開了，你就是去補繳，補完了，會再退款給
房東，你們再自己去商量怎麼收付這筆款項……

請問，這樣是合理的嗎？不能出示收據就不用重覆繳這筆錢嗎？
我是疑問，你現在電腦都查不到房東前兩年都繳過這筆錢了，
現在我補繳，你們電腦會...自動發現嗎？如果沒發現，是不是我們要自行救濟了？

（也是因為經過這一次才知道每個月付租金都要先幫房東繳10%的稅金，
　　給的租金可以再商量看是不是從房租扣掉）

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